RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 SMIM18P0DKX4 95 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 NQO2P16083 231 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 PRSS3P35030 304 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 ECI1P42126 302 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 RORCP51449 518 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 HERV-K104P61576 105 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 CD69Q07108 199 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 TATDN3Q17R31 274 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 MS4A10Q96PG2 267 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 OR5B12Q96R08 314 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 OR4C12Q96R67 309 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 PHB2Q99623 299 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 COA4Q9NYJ1 87 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 EHFQ9NZC4 300 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 A8MZ25 164 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 MPPED1O15442 326 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 SAP30O75446 220 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 HLA-GP17693 338 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 GNRHRP30968 328 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 RCVRNP35243 200 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 TGFBR1P36897 503 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 NCS1P62166 190 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 RHOGP84095 191 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 CTF1Q16619 201 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 OR4A47Q6IF82 309 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 MZT2AQ6P582 158 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 ATP6V0BQ99437 205 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 H0Y980 276 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 GP9P14770 177 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 CTRB1P17538 263 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 TBPP20226 339 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 F2RP25116 425 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 PSMB6P28072 239 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 S100GP29377 79 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 UCP3P55916 312 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 VBP1P61758 197 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 ZNF45Q02386 682 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 ATP5G2Q06055 141 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 GPR107Q5VW38 600 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 PRR25Q96S07 402 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 PEMTQ9UBM1 199 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 J3QRK9 145 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 LGALS9O00182 355 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 GPR31O00270 319 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 UPK2O00526 184 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 CYB5BO43169 146 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 PTHLHP12272 177 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 SPNP16150 400 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 ALDH3B2P48448 385 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 FXYD4P59646 89 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 OR2B8PP59922 312 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 RPEL1Q2QD12 228 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.93□□□□□ -1.3
PKP4-218ENST00000629219 LAX1Q8IWV1 398 aa6.93□□□□□ -1.3
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