RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	MTURN	Q8N3F0	131 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	ALPK3	Q96L96	1907 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362		A6NNC1	897 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	MDP1	Q86V88	176 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	C18orf15	Q96N68	181 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	ZPBP	Q9BS86	351 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	DNPH1	O43598	174 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	GDF9	O60383	454 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	IL9	P15248	144 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	GCHFR	P30047	84 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	NABP2	Q9BQ15	211 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		10.03	□□□□□ -0.8
FAM200B-223	ENST00000622362	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	SMIM13	P0DJ93	91 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	MPV17	P39210	176 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	NXPH1	P58417	271 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	PLXNA2	O75051	1894 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	CEACAM1	P13688	526 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	SSPN	Q14714	243 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	PYY3	Q5JQD4	70 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	TCF19	Q9Y242	345 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	UCP3	P55916	312 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	P2RY6	Q15077	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNMB1	Q16558	191 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	TCF23	Q7RTU1	214 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		10.02	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1B0GTI1	187 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	MGST3	O14880	152 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	TYMS	P04818	313 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	ERG	P11308	486 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362		H3BUT2	72 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP5G3	P48201	142 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	TCF24	Q7RTU0	167 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	DRAM1	Q8N682	238 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	WDR54	Q9H977	334 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	IL4	P05112	153 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	EGR4	Q05215	589 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	OR11H1	Q8NG94	326 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	FGF16	O43320	207 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC25A17	O43808	307 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	AREG	P15514	252 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	CCL20	P78556	96 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	TFF2	Q03403	129 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	STPG3	Q8N7X2	389 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	IL36B	Q9NZH7	164 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A087WV48	116 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362		K7EQS6	105 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	SOX8	P57073	446 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	HBB	P68871	147 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	CCL8	P80075	99 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	RABAC1	Q9UI14	185 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		10	□□□□□ -0.81
FAM200B-223	ENST00000622362	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10	□□□□□ -0.81

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