RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PF4V1P10720 104 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 VEGFBP49765 207 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ABCA4P78363 2273 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 AQP3Q92482 292 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GLI3P10071 1580 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PF4P02776 101 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ISG15P05161 165 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEA5P43359 124 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PEMTQ9UBM1 199 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 EML5Q05BV3 1969 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TNFSF15O95150 251 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CD8AP01732 235 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PRF1P14222 555 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF137PP52743 207 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SIP14410 1827 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PGPA6NDG6 321 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RRHO14718 337 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PRR13Q9NZ81 148 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OBSL1O75147 1896 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 J3QW42 95 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM258P61165 79 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 HCSTQ9UBK5 93 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFC2O95298 119 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 KLK2P20151 261 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PATE1Q8WXA2 126 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 VSTM2LQ96N03 204 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 M0R2P5 195 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SYNGR3O43761 229 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PNLIPP16233 465 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CTAG1AP78358 180 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RFESDQ8TAC1 157 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GPR183P32249 361 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GUT8 65 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 A8MXK9 166 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ECSCRQ19T08 205 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PIGYQ3MUY2 71 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GAGE13Q4V321 117 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GFERP55789 205 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TBR1Q16650 682 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 EML2O95834 649 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 NPPCP23582 126 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 PDCD1Q15116 288 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SRD5A1P18405 259 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SRIP30626 198 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ATP5G2Q06055 141 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 P2RY6Q15077 328 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM42Q69YG0 159 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 RASL11AQ6T310 242 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SRFP11831 508 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF83P51522 516 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK11-1P61568 191 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC61Q9BV99 259 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ROS1P08922 2347 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 F2Z2F3 143 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 VSIG8P0DPA2 414 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 IFITM3Q01628 133 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 DUX5Q96PT3 197 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.03□□□□□ -1.44
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