RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 KBTBD11O94819 623 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SPDEFO95238 335 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV2-23P01705 113 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 EBI3Q14213 229 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf62Q8N4C0 152 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX45Q8NA69 505 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2T10Q8NGZ9 312 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 GRPEL2Q8TAA5 225 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB40CQ96S21 281 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPR3Q14573 2671 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNGR2O43760 224 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 LY86O95711 162 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 MOSP00540 346 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF345Q14585 488 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 THNSL2Q86YJ6 484 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM14BQ9NUH8 114 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 AVPP01185 164 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 C4BPBP20851 252 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf50Q8WW18 174 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2F2O95006 317 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY1P47900 373 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2F1Q13607 317 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX29Q8N6K0 151 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 MFFQ9GZY8 342 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 MEGF9Q9H1U4 602 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf1Q9H5F2 150 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 L7N2F9 121 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1D-33P01593 117 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1-33P01594 117 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNLT3P51808 116 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SPCS3P61009 180 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 VAMP2P63027 116 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0D9SG52 128 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SSSCA1O60232 199 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R30P59541 319 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 AQP10Q96PS8 301 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGT1Q9H0U3 335 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPB11Q9Y547 144 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 WSB1Q9Y6I7 421 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV3A0A0B4J244 114 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CHST1O43916 411 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR137BO60478 399 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM106CPP0CH98 169 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A17O43808 307 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2B8PP59922 312 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL8P62917 257 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PSG5Q15238 335 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 BRD3OSQ6XYD6 125 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 NPBQ8NG41 125 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5B3Q8NH48 314 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 NANPQ8TBE9 248 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 RITA1Q96K30 269 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM96BQ9Y3D0 163 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF222A6NCQ9 220 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 NXPH3O95157 252 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA17P01571 189 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYGBP07316 175 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 FBP1P09467 338 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCL2P19875 107 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
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CAPNS1-206ENST00000588815 RBKSQ9H477 322 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CSPG4Q6UVK1 2322 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 FSHBP01225 129 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HES1Q14469 280 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 MMD2Q8IY49 270 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8N6K4 173 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8H1Q8NGG4 311 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1456Q9P272 454 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP50Q9UKX7 468 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 NBR2O15453 112 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFA3O95167 84 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 MAS1LP35410 378 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNRGQ8N5I3 272 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2C3Q8N628 320 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SIGLEC9Q9Y336 463 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51B2Q9Y5P1 312 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-206ENST00000588815 RRHO14718 337 aa24.85■■□□□ 1.57
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