RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 J3QT63 122 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 CNIH1O95406 144 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 IFNGP01579 166 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 P0C879 139 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 CCL3L1P16619 93 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 CNTFRP26992 372 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 CD34P28906 385 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 KDELR2P33947 212 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 OR1E2P47887 323 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 CX3CR1P49238 355 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 PITPNAQ00169 270 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 HES1Q14469 280 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 ATP6AP1Q15904 470 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 COQ5Q5HYK3 327 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 NAA40Q86UY6 237 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 AQP3Q92482 292 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 AGPAT2O15120 278 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 DEGS2Q6QHC5 323 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRM-208ENST00000578600 LINC01619G3V211 115 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 CDC42EP2O14613 210 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 NRASP01111 189 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV1-47P01700 117 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 SPNP16150 400 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 IL3RAP26951 378 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 HAAOP46952 286 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 MTPNP58546 118 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TAS2R19P59542 299 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-208ENST00000578600 APOFQ13790 326 aa3.83□□□□□ -1.8
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