RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 C11orf52Q96A22 123 aa3.66□□□□□ -1.82
TRIM25-208ENST00000574234 GALNT14Q96FL9 552 aa3.66□□□□□ -1.82
TRIM25-208ENST00000574234 AMELYQ99218 206 aa3.66□□□□□ -1.82
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.66□□□□□ -1.82
TRIM25-208ENST00000574234 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.66□□□□□ -1.82
TRIM25-208ENST00000574234 RNF167Q9H6Y7 350 aa3.66□□□□□ -1.82
TRIM25-208ENST00000574234 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC167Q9P0B6 97 aa3.66□□□□□ -1.82
TRIM25-208ENST00000574234 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 K7EQD1 137 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 NXPH4O95158 308 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 TRBV12-3P01733 135 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 HLA-DMBP28068 263 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 GLP1RP43220 463 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 MAP2K4P45985 399 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 PLP1P60201 277 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 ERVK-16P61578 105 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 STX3Q13277 289 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 CRMP1Q14194 572 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 LINC00596Q86U02 117 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 LFNGQ8NES3 379 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 USMG5Q96IX5 58 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 RDH12Q96NR8 316 aa3.65□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 OR52B2Q96RD2 323 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 MPTX1A8MV57 137 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 RS1O15537 224 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 E2F6O75461 281 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 OR9G9P0C7N8 305 aa3.64□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 TIGITQ495A1 244 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 Q6ZSR3 168 aa3.64□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.64□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 OR4A5Q8NH83 315 aa3.64□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 OR51E1Q8TCB6 317 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.64□□□□□ -1.83
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TRIM25-208ENST00000574234 BCL3P20749 454 aa3.63□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 LIPEQ05469 1076 aa3.63□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 LAGE3Q14657 143 aa3.63□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.63□□□□□ -1.83
TRIM25-208ENST00000574234 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.63□□□□□ -1.83
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