RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-208	ENST00000563857	FCER2	P06734	321 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ZP3	P21754	424 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	GNRHR	P30968	328 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	UCP3	P55916	312 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TATDN3	Q17R31	274 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	CADM3	Q8N126	398 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	MS4A10	Q96PG2	267 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	COA4	Q9NYJ1	87 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TNFSF12	O43508	249 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	F2R	P25116	425 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	DGCR2	P98153	550 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	POU2AF1	Q16633	256 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	DEFB136	Q30KP8	78 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	GNB4	Q9HAV0	340 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	GABARAP	H6UMI1	98 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	OVOL1	O14753	267 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ECI1	P42126	302 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TAS2R19	P59542	299 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF429	Q86V71	674 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	OR51H1	Q8NH63	302 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	MRAP	Q8TCY5	172 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	DUX3	Q96PT4	197 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	OR5B12	Q96R08	314 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-208	ENST00000563857	ATG12	O94817	140 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	HLA-G	P17693	338 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	MEF2D	Q14814	521 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	SPCS2	Q15005	226 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	CTDSPL	O15194	276 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	SNAPC5	O75971	98 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	ATP5G2	Q06055	141 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	OR4A47	Q6IF82	309 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	NECAP1	Q8NC96	275 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	OR52I2	Q8NH67	350 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	ISOC1	Q96CN7	298 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	CCDC160	A6NGH7	325 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	B3GALNT1	O75752	331 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	IGHV3-11	P01762	117 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	RLN1	P04808	185 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	ZNF735	P0CB33	412 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	RPA2	P15927	270 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	IL18	Q14116	193 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	SSX9	Q7RTT3	188 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	OR4C12	Q96R67	309 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	THYN1	Q9P016	225 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	DISC1	C4P0D8	188 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857		H3BMQ9	156 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	UPK2	O00526	184 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNPS1-208	ENST00000563857	CTDSP2	O14595	271 aa		12.42	□□□□□ -0.42

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