RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559		M0R1B8	84 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	RRH	O14718	337 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G5	P39877	138 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	LCN2	P80188	198 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	RTP5	Q14D33	572 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	MSMP	Q1L6U9	139 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TCF19	Q9Y242	345 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPQ1	181 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CXorf1	O96002	111 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CGB3	P0DN86	165 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CGB7	P0DN87	165 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GATA4	P43694	442 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	IMMP2L	Q96T52	175 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RRN3-205	ENST00000563559	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf61	A6NNL5	157 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	STAG3L2	P0CL84	134 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	STAG3L3	P0CL85	134 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	DEFA4	P12838	97 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	NPPC	P23582	126 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	THBS3	P49746	956 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	LINC01551	Q86U37	167 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OR1P1	Q8NH06	330 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	MGST2	Q99735	147 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SELENOV	P59797	346 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	GNB1	P62873	340 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	RAB31	Q13636	194 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	FAM222B	Q8WU58	562 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SPRY3	O43610	288 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2G2	P60604	165 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	RHOV	Q96L33	236 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CHODL	Q9H9P2	273 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ENY2	Q9NPA8	101 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SVIL	O95425	2214 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	XKRY2	A2RUG3	117 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	DVL1	O14640	695 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFB4	O95168	129 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SDSL	Q96GA7	329 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	RNF7	Q9UBF6	113 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5G3	P48201	142 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TEPP	Q6URK8	271 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OR5R1	Q8NH85	324 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SLC31A2	O15432	143 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-7	P01780	117 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	NPY1R	P25929	384 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	PDLIM4	P50479	330 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CORO2A	Q92828	525 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CAD	P27708	2225 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	FNDC10	F2Z333	226 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	MT-CO2	P00403	227 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	FOXL1	Q12952	345 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	MIC13	Q5XKP0	118 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OR4A47	Q6IF82	309 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	IL19	Q9UHD0	177 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNA7	P36544	502 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RRN3-205	ENST00000563559	RHOB	P62745	196 aa		15.16	■□□□□ 0.02

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