RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 CADM3Q8N126 398 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRB-209ENST00000550857 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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PTPRB-209ENST00000550857 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-209ENST00000550857 C8orf88P0DMB2 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 RANP62826 216 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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PTPRB-209ENST00000550857 FCN2Q15485 313 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TOR2AQ5JU69 321 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-209ENST00000550857 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.74□□□□□ -1.33
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