RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZSN1 163 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CMTM3Q96MX0 182 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMPXQ9UHP9 88 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.22□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KNCNA6PVL3 124 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHEK1O14757 476 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAPSAO96009 420 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYGCP07315 174 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRASP10301 218 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10K2Q6IF99 312 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM210BQ96KR6 192 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00473A8K010 186 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFA4O00483 81 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAFAH1B2P68402 229 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XAF1Q6GPH4 301 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFSD4AQ8N468 514 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7EMT4 169 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BET1O15155 118 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FCGR3BO75015 233 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKBP6O75344 327 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YIF1AO95070 293 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF735P0CB33 412 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPP1P10451 314 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRHBPP24387 322 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTR2CP28335 458 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPBGQ13641 420 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCF24Q7RTU0 167 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYS1Q8N2H4 156 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LGALS12Q96DT0 336 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRBF2Q96F24 287 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51E2Q9H255 320 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CKLFQ9UBR5 152 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AK3Q9UIJ7 227 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 J3QRK9 145 aa7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.267e-6■□□□□ 9.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA24Q86W54 205 aa7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CIB1Q99828 191 aa7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM107BQ9H098 131 aa7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RABAC1Q9UI14 185 aa7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C15orf62A8K5M9 175 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 G3V2T6 193 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAS1LP35410 378 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP10-1P60331 282 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP6AP1Q15904 470 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNK15Q9H427 330 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q9N2K0 584 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.17□□□□□ -1.26
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