RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM216AQ8WUB2 273 aa10.21□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 RNF150Q9ULK6 438 aa10.21□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 OR2W1Q9Y3N9 320 aa10.21□□□□□ -0.77
RPUSD4-208ENST00000533628 JMJD1CQ15652 2540 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TIMM23O14925 209 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 RAB29O14966 203 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 FGF16O43320 207 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 BCL2L11O43521 198 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 PMP2P02689 132 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 MT-ND4LP03901 98 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 OR8U9P0C7N5 309 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 IGKV1-13P0DP09 117 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TAS2R46P59540 309 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 RPL39P5Q59GN2 51 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 FAM71F2Q6NXP2 309 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 OR8U1Q8NH10 309 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 OR5R1Q8NH85 324 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 RHOVQ96L33 236 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TAS2R8Q9NYW2 309 aa10.21□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 A6NDX4 124 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TCAPO15273 167 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 RAB4AP20338 218 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 VAMP1P23763 118 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 FCGR2CP31995 323 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 HRH1P35367 487 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 LUMP51884 338 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 AKR1C2P52895 323 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 AKR1C1Q04828 323 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 THNSL2Q86YJ6 484 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 DRAM1Q8N682 238 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 NABP2Q9BQ15 211 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TNFRSF19Q9NS68 423 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TCF19Q9Y242 345 aa10.2□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 OR2F2O95006 317 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 IGLV2-14P01704 120 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CD74P04233 296 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 AADACP22760 399 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CD24P25063 80 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 OR2F1Q13607 317 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 EBI3Q14213 229 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 ACTBL2Q562R1 376 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 PYY3Q5JQD4 70 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 VAX1Q5SQQ9 334 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 OR5H2Q8NGV7 314 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 UQCC1Q9NVA1 299 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 EHFQ9NZC4 300 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 GOSR2O14653 212 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 PPYP01298 95 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CT45A6P0DMU7 189 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CT45A5P0DMU8 189 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CT45A7P0DMV0 189 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 NQO2P16083 231 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TBPP20226 339 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 BRS3P32247 399 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 C2orf68Q2NKX9 166 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 IL34Q6ZMJ4 242 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF383Q8NA42 475 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 OR2D2Q9H210 308 aa10.19□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CHST1O43916 411 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR137BO60478 399 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CD3DP04234 171 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CSF1P09603 554 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CD1BP29016 333 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 DDTP30046 118 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 GPR12P47775 334 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 LINC00205P59089 165 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 LY6EQ16553 131 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 MOB3BQ86TA1 216 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF546Q86UE3 836 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 S1PR3Q99500 378 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 BTBD17A6NE02 478 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 M0QYG6 137 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TAS2R19P59542 299 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 CD81P60033 236 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 Q8N6K4 173 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 OR52B4Q8NGK2 314 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 TUBA4BQ9H853 241 aa10.18□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF735P0CB33 412 aa10.17□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 PKIAP61925 76 aa10.17□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF645Q8N7E2 425 aa10.17□□□□□ -0.78
RPUSD4-208ENST00000533628 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms