RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPBQ8NG41 125 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4A5Q8NH83 315 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HINT2Q9BX68 163 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BET1LQ9NYM9 111 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRNDQ9UKY0 176 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCF19Q9Y242 345 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.8□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CR1P17927 2039 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A6NDX4 124 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INAFM1C9JVW0 142 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST8SIA3O43173 380 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACTL6BO94805 426 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2F2O95006 317 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNIH1O95406 144 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFNA17P01571 189 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OPN1MWP04001 364 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RLN2P04090 185 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYGBP07316 175 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S100A10P60903 97 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAP2BP61225 183 aa6.79□□□□□ -1.32
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RELBQ01201 579 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNXAQ16473 311 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRSS8Q16651 343 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MMD2Q8IY49 270 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5R1Q8NH85 324 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASB13Q8WXK3 278 aa6.79□□□□□ -1.32
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COA4Q9NYJ1 87 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.79□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMLR1H3BR10 107 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WRBO00258 174 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FCN1O00602 326 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PITX3O75364 302 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MED6O75586 246 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFA3O95167 84 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYOD1P15172 320 aa6.78□□□□□ -1.32
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAS1LP35410 378 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPCS3P61009 180 aa6.78□□□□□ -1.32
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB32Q13637 225 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPINK9Q5DT21 86 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THAP6Q8TBB0 222 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEURL2Q9BR09 285 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBKSQ9H477 322 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ENY2Q9NPA8 101 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZFP57Q9NU63 452 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ITPR2Q14571 2701 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 L7N2F9 121 aa6.77□□□□□ -1.33
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0QZK8 103 aa6.77□□□□□ -1.33
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