RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 EDDM3AQ14507 147 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 FAM201AQ5SY85 155 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 GALMQ96C23 342 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 JKAMPQ9P055 326 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 KIAA1456Q9P272 454 aa6.85□□□□□ -1.31
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SOX6-210ENST00000528252 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.85□□□□□ -1.31
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SOX6-210ENST00000528252 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.85□□□□□ -1.31
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SOX6-210ENST00000528252 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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SOX6-210ENST00000528252 ACY3Q96HD9 319 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 VPS25Q9BRG1 176 aa6.85□□□□□ -1.31
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SOX6-210ENST00000528252 A0A1W2PN81 502 aa6.84□□□□□ -1.31
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SOX6-210ENST00000528252 GNMTQ14749 295 aa6.84□□□□□ -1.31
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SOX6-210ENST00000528252 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 NSG2Q9Y328 171 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX6-210ENST00000528252 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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SOX6-210ENST00000528252 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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SOX6-210ENST00000528252 LHBP01229 141 aa6.84□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 NMSQ5H8A3 153 aa6.84□□□□□ -1.32
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SOX6-210ENST00000528252 NUP37Q8NFH4 326 aa6.84□□□□□ -1.32
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SOX6-210ENST00000528252 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.84□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 GCM1Q9NP62 436 aa6.84□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.84□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.83□□□□□ -1.32
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SOX6-210ENST00000528252 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 CCL8P80075 99 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 ADIPOQQ15848 244 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 LTC4SQ16873 150 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 CST9LP1Q5W188 147 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.83□□□□□ -1.32
SOX6-210ENST00000528252 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.83□□□□□ -1.32
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