RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 H3BP45 60 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TM4SF5O14894 197 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SIVA1O15304 175 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 HAND1O96004 215 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ID1P41134 155 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ASCL1P50553 236 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 COX19Q49B96 90 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 OR8G5Q8NG78 346 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 OR4X1Q8NH49 305 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 STARD4Q96DR4 205 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 MPPED1O15442 326 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TFF1P04155 84 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZS92 163 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 GALMQ96C23 342 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 IL36GQ9NZH8 169 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SAP30O75446 220 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZRG5 221 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SSSCA1O60232 199 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 CNIH1O95406 144 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ATP5J2P56134 94 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SRPXP78539 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 WDR82Q6UXN9 313 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SDSLQ96GA7 329 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A10Q96PG2 267 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TPPP3Q9BW30 176 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 NMES1Q9C002 83 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 Q9N2K0 584 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 NAT8Q9UHE5 227 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 B4DEV8 164 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 K7EQM0 130 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 TGFAP01135 160 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 HARBI1Q96MB7 349 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 OR51I2Q9H344 312 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 C16orf97H3BN30 126 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 H3BQ15 152 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 SPINT2O43291 252 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ADAM20O43506 726 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 GPR12P47775 334 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 HLA-DRB3P79483 266 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 CCL8P80075 99 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 COL10A1Q03692 680 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 IL13RA2Q14627 380 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 LRP11Q86VZ4 500 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 GLMPQ8WWB7 406 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 MRAP2Q96G30 205 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms