RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C9orf66Q5T8R8 295 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LPCAT3Q6P1A2 487 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HRASLSQ9HDD0 168 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DPPA5A6NC42 116 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GPR31O00270 319 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RLN1P04808 185 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR9G9P0C7N8 305 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NQO2P16083 231 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MAS1LP35410 378 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TAS2R31P59538 309 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FCAMRQ8WWV6 532 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ERVK-16P61578 105 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ASPHD1Q5U4P2 390 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LAX1Q8IWV1 398 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR4A5Q8NH83 315 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FXYD6Q9H0Q3 95 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DNAH3Q8TD57 4116 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BRI3O95415 125 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TGP01266 2768 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TBPP20226 339 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C10orf55Q5SWW7 151 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR4A47Q6IF82 309 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OR52I2Q8NH67 350 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 USMG5Q96IX5 58 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PLEKHA2Q9HB19 425 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BET1LQ9NYM9 111 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COMMD9Q9P000 198 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KLK11Q9UBX7 282 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 A0A087WW49 117 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC160A6NGH7 325 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 M0QYG6 137 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CTDSP2O14595 271 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 OVOL1O14753 267 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HLA-GP17693 338 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 F2RP25116 425 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KRTAP10-11P60412 298 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DGCR2P98153 550 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DCUN1D4Q92564 292 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ISOC1Q96CN7 298 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ABHD1Q96SE0 405 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 H3BMQ9 156 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 S1PR2O95136 353 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 INSL3P51460 131 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLURP1P55000 103 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TNCP24821 2201 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ANKRD34BA5PLL1 514 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM223BA6NKX1 122 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GABARAPH6UMI1 98 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DHFRP00374 187 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CD3DP04234 171 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PGAM2P15259 253 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZP3P21754 424 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TAS2R19P59542 299 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RHOGP84095 191 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IL18Q14116 193 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM223AQ8IWN6 122 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TTC9CQ8N5M4 171 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 COMMD5Q9GZQ3 224 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TMEM140Q9NV12 185 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HMX3A6NHT5 357 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LPAR6P43657 344 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UCP3P55916 312 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP5G2Q06055 141 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 POU2AF1Q16633 256 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARRDC1Q8N5I2 433 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC2A9Q9NRM0 540 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms