RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 PITX3O75364 302 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 HAGHQ16775 308 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 TIGITQ495A1 244 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 Q5PR19 223 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 CXorf58Q96LI9 332 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 JMJD8Q96S16 334 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 NOTCH2Q04721 2471 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM8Q96KF7 97 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 GINS3Q9BRX5 216 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 CT45A10P0DMU9 189 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 B2MP61769 119 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 SELENOTP62341 195 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 JKAMPQ9P055 326 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 NBR2O15453 112 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 PRTN3P24158 256 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 BTCP35070 178 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 H2BFSP57053 126 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 DOK5Q9P104 306 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF737O75373 536 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 ATRXP46100 2492 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 PLCE1Q9P212 2302 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 TIMM23O14925 209 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 MSMBP08118 114 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 OR10J4P0C629 311 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 NHLH2Q02577 135 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 OR4X1Q8NH49 305 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SUN5Q8TC36 379 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 MALSU1Q96EH3 234 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 P2RX4Q99571 388 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 CD8AP01732 235 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 MAS1LP35410 378 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 MFAP4P55083 255 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 CD300CQ08708 224 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A22Q9H936 323 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SEC11BP0C7V7 166 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 RAB4BP61018 213 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 Q8NFD4 153 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 RNF223E7ERA6 249 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 ITGB1BP1O14713 200 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SERF2P84101 59 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 FAM78BQ5VT40 261 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 TEX45Q8NA69 505 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 AQP10Q96PS8 301 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 AKR1C3P42330 323 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 ARPC1AQ92747 370 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-211ENST00000486161 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
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