RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-206	ENST00000465525	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	CLCC1	Q96S66	551 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	MYOD1	P15172	320 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	LGALS7	P47929	136 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	DYNLT3	P51808	116 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	NBR2	O15453	112 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	IER3	P46695	156 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525		Q6YL49	198 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	RRH	O14718	337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	OR2A4	O95047	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	HLA-G	P17693	338 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	UBE2K	P61086	200 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	PLGLA	Q15195	96 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	TNC	P24821	2201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	UPK2	O00526	184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	KBTBD11	O94819	623 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	RELB	Q01201	579 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	RNF5	Q99942	180 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525		A6NDX4	124 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	FCN1	O00602	326 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	CHST1	O43916	411 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	OPN1MW	P04001	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	CRYGB	P07316	175 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	SPINK9	Q5DT21	86 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	NPB	Q8NG41	125 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	OR4A16	Q8NH70	328 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	KIAA1456	Q9P272	454 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRU-206	ENST00000465525	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525		A0A1B0GU03	582 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	SNAPC5	O75971	98 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	NDUFA3	O95167	84 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	GNB1	P62873	340 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525		Q8N9W7	124 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRU-206	ENST00000465525	PITX3	O75364	302 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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