RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PPY	P01298	95 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PRH1	P02810	166 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TGFBR1	P36897	503 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GW64	132 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	BMPR1B	O00238	502 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	XRCC3	O43542	346 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CSN3	P07498	182 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MAS1L	P35410	378 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CBX5	P45973	191 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KLK9	Q2XQG4	91 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFSF12	O43508	249 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	NECAP1	Q8NC96	275 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738		H0Y980	276 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	AIRE	O43918	545 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	HRAS	P01112	189 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYGC	P07315	174 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2J3	O76001	311 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	C15orf32	Q32M92	178 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM209B	Q5JX69	171 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4A47	Q6IF82	309 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SSX9	Q7RTT3	188 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087WXM4	84 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	FCER2	P06734	321 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	CTRB1	P17538	263 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R31	P59538	309 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	SULT1C2	O00338	296 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	HPRT1	P00492	218 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	MYOD1	P15172	320 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	AREG	P15514	252 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-G	P17693	338 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	NAT1	P18440	290 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMB6	P28072	239 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	FXYD4	P59646	89 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	CATR1	Q13166	79 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738		Q8N402	240 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	FGF2	P09038	288 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MRPL28-203	ENST00000429738	NQO2	P16083	231 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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