RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPIPB3Q92617 1050 aa12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MCM3APO60318 1980 aa12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGKV3-15P01624 115 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 THY1P04216 161 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL36BQ9NZH7 164 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRPM6Q9BX84 2022 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LIPFP07098 398 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAS2R60P59551 318 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PR77 199 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPPCP23582 126 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMIM13P0DJ93 91 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDYHV1Q96HA8 205 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIR2DL4Q99706 377 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF883P0CG24 379 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DUX5Q96PT3 197 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H3BTX0 84 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRYBA2P53672 197 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF56Q15929 161 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACP7Q6ZNF0 438 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A0G2JK05 382 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PQM1 296 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A1L4Q6 167 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RRHO14718 337 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXH1O75593 365 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MOSP00540 346 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLRB1Q12918 225 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BIVMQ86UB2 503 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CBLN1P23435 193 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL39P5Q59GN2 51 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATOH7Q8N100 152 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL4P05112 153 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IFI27L2Q9H2X8 130 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PNKDQ8N490 385 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPSB2Q99619 263 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A087WWC5 75 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DPRXA6NFQ7 191 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZIC3O60481 467 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 Q6ZT83 130 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FMC1Q96HJ9 113 aa12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SHISA3A0PJX4 238 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TM4SF5O14894 197 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NRN1LQ496H8 165 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MEIG1Q5JSS6 88 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SGK494Q96LW2 274 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPFFO15130 113 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTC32Q5I0X7 151 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF414Q96IQ9 312 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNS1Q96KK3 526 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPIPB7O75200 414 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLK15Q9H2R5 256 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPRMQ9NS64 109 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SRP19P09132 144 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C19orf48Q6RUI8 117 aa12.65□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A8MXK9 166 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TFF3Q07654 80 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLDND2Q8NHS1 167 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1B0GV90 55 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP1R17O96001 155 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRSS2P07478 247 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTURNQ8N3F0 131 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TIMP4Q99727 224 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UCP1P25874 307 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TIMM23BQ5SRD1 257 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C1QL2Q7Z5L3 287 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EPOPA6NHQ4 379 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM159AQ6UWV7 190 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms