RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC01551Q86U37 167 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 DRAM1Q8N682 238 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC01560Q8TB33 94 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 NSG2Q9Y328 171 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC30A6NM36 301 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 C15orf65H3BRN8 121 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 CD3EP07766 207 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 CD55P08174 381 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 WNT2P09544 360 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 LTC4SQ16873 150 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 NMSQ5H8A3 153 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 STUMQ69YW2 141 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ARV1Q9H2C2 271 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.3□□□□□ -1.08
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LRRTM4-202ENST00000409093 ITPR1Q14643 2758 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1B0GV72 72 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF212BA8MTL3 300 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 E7EQL1 145 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 DFFBO76075 338 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 NDUFB8O95169 186 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 SULT1A1P50225 295 aa8.3□□□□□ -1.08
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LRRTM4-202ENST00000409093 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 NEUROG1Q92886 237 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 SDSLQ96GA7 329 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 YPEL4Q96NS1 127 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 CST9LQ9H4G1 147 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.3□□□□□ -1.08
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LRRTM4-202ENST00000409093 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.29□□□□□ -1.08
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LRRTM4-202ENST00000409093 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.29□□□□□ -1.08
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LRRTM4-202ENST00000409093 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.29□□□□□ -1.08
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LRRTM4-202ENST00000409093 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.29□□□□□ -1.08
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LRRTM4-202ENST00000409093 M0R036 132 aa8.28□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 SSSCA1O60232 199 aa8.28□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 NXPH3O95157 252 aa8.28□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 STAG3L2P0CL84 134 aa8.28□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 CATR1Q13166 79 aa8.28□□□□□ -1.08
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LRRTM4-202ENST00000409093 CR1LQ2VPA4 569 aa8.28□□□□□ -1.08
LRRTM4-202ENST00000409093 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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