RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4X1Q8NH49 305 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4C12Q96R67 309 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV2-14P01704 120 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 IAPPP10997 89 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 MPV17P39210 176 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC38A11Q08AI6 406 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 BSXQ3C1V8 233 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ALKBH6Q3KRA9 238 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 SSX9Q7RTT3 188 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A40Q8TBP6 338 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 MBD6Q96DN6 1003 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 RBKSQ9H477 322 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ACANP16112 2415 aa21.81■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 IL2RGP31785 369 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 PDZD11Q5EBL8 140 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 RDH5Q92781 318 aa21.8■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 BTF3L4Q96K17 158 aa21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 LY6HO94772 140 aa21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 SNX22Q96L94 193 aa21.8■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GX30 115 aa21.79■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 GCGP01275 180 aa21.79■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF585BQ52M93 769 aa21.79■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 PPP5D1E7EU14 171 aa21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 Q6P435 159 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF497Q6ZNH5 498 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51I2Q9H344 312 aa21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 H7BYZ3 331 aa21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 SPANXN5Q5MJ07 72 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf82Q7Z2V1 217 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51G1Q8NGK1 321 aa21.78■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4-39P01824 125 aa21.76■■□□□ 1.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 TYMSP04818 313 aa21.75■■□□□ 1.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM170AQ8WVE7 144 aa21.75■■□□□ 1.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZANQ9Y493 2812 aa21.75■■□□□ 1.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 FGFRL1Q8N441 504 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 RTL8AQ9BWD3 113 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 COL10A1Q03692 680 aa21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 BEND2Q8NDZ0 799 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 WFDC11Q8NEX6 87 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf88Q9BSF0 95 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 CXXC4Q9H2H0 198 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 AMBPP02760 352 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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