RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 RNF212BA8MTL3 300 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 C22orf46C9J442 243 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 EFNA2O43921 213 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CLDN14O95500 239 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CA2P00918 260 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SRIP30626 198 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 MORN2Q502X0 79 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 OCC1Q8TAD7 63 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 TNFRSF14Q92956 283 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM12Q96EX1 92 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CORTO00230 105 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 MLNRO43193 412 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SYNGR2O43760 224 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CLDN1O95832 211 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINE2P07093 398 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CA7P43166 264 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 NHLH1Q02575 133 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 RAET1LQ5VY80 246 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 RARRES3Q9UL19 164 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SLC22A20A6NK97 555 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CD300LBA8K4G0 201 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 H0Y8G0 127 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 PSG7Q13046 419 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 FXYD3Q14802 87 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 BORCS7Q96B45 105 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 BMI1P35226 326 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 TCTAP57738 103 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 HTD2P86397 168 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 C12orf49Q9H741 205 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 hDV102S1A0JD36 115 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 OR7C2O60412 319 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 PIAS2O75928 621 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CTXN2P0C2S0 81 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 PRRX1P54821 245 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SERF2P84101 59 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 FOXE3Q13461 319 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 PMCHL1Q16048 86 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 OR1L1Q8NH94 360 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 GPR27Q9NS67 375 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PR77 199 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 FAM166BA8MTA8 275 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 DHRS3O75911 302 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 UQCRFS1P47985 274 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 FOXL1Q12952 345 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 MALLQ13021 153 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 PLCE1Q9P212 2302 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 A0A087X0K7 114 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SCRG1O75711 98 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ZFAND5O76080 213 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 UCP1P25874 307 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 HBG1P69891 147 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 HBG2P69892 147 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 CCL7P80098 99 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 RHOGP84095 191 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SRYQ05066 204 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 MUC15Q8N387 334 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM186Q96B77 213 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-211ENST00000618610 KCNS1Q96KK3 526 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms