RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
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PTPRJ-207ENST00000613246 VSIG10L2P0DP72 767 aa16.1■□□□□ 0.17
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PTPRJ-207ENST00000613246 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRJ-207ENST00000613246 FLRT3Q9NZU0 649 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRJ-207ENST00000613246 COX11Q9Y6N1 276 aa16.1■□□□□ 0.17
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PTPRJ-207ENST00000613246 KLK13Q9UKR3 277 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTPRJ-207ENST00000613246 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTPRJ-207ENST00000613246 LINC00614P0C842 121 aa16.05■□□□□ 0.16
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PTPRJ-207ENST00000613246 CENPWQ5EE01 88 aa16.05■□□□□ 0.16
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PTPRJ-207ENST00000613246 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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PTPRJ-207ENST00000613246 FAM209AQ5JX71 171 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-207ENST00000613246 C1QL1O75973 258 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-207ENST00000613246 IGHV3-23P01764 117 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRJ-207ENST00000613246 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-207ENST00000613246 SFTPCP11686 197 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXW9Q5XUX1 488 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-207ENST00000613246 CD69Q07108 199 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.04■□□□□ 0.16
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