RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SULT1C4	O75897	302 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC00315	P59091	139 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PAX5	Q02548	391 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A087WTM6	91 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GYG2	O15488	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FKBP6	O75344	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KDM4B	O94953	1096 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OCM2	P0CE71	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	APELA	P0DMC3	54 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MYOD1	P15172	320 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARL3	P36405	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KCNJ3	P48549	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HCCS	P53701	268 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CRISP1	P54107	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MTCP1	P56278	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PSG5	Q15238	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RCN1	Q15293	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LPA	P08519	4548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		H0YJX3	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RAB27B	O00194	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRKY	O43930	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RBBP9	O75884	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PRH1	P02810	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MT-ND2	P03891	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	REG1A	P05451	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EMP1	P54849	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMED1	Q13445	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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