RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SPSB3Q6PJ21 355 aa20.96■□□□□ 0.95
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CAPNS1-204ENST00000587718 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00574Q9H8X3 128 aa20.96■□□□□ 0.95
CAPNS1-204ENST00000587718 C9JQL5 133 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRY3O43610 288 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV1-46P01743 117 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR12P47775 334 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 FHITP49789 147 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 STUMQ69YW2 141 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf71Q6IPW1 123 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A24Q6NUK1 477 aa20.95■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 PSG11Q9UQ72 335 aa20.95■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf98A8MV24 154 aa20.94■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 INAFM1C9JVW0 142 aa20.94■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRIMA1Q86XR5 153 aa20.94■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 TUBA4BQ9H853 241 aa20.93■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 CBLN4Q9NTU7 201 aa20.93■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR10A7Q8NGE5 316 aa20.91■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa20.9■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF788Q6ZQV5 615 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 MUC15Q8N387 334 aa20.9■□□□□ 0.94
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CAPNS1-204ENST00000587718 RHEBQ15382 184 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 HFEQ30201 348 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 KHDC3LQ587J8 217 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-204ENST00000587718 PLCE1Q9P212 2302 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV3-43DP0DP04 118 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-204ENST00000587718 GNB2P62879 340 aa20.89■□□□□ 0.93
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