RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
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FAM227B-211ENST00000560557 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
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FAM227B-211ENST00000560557 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
FAM227B-211ENST00000560557 KIF24Q5T7B8 1368 aa0.04□□□□□ -2.4
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FAM227B-211ENST00000560557 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa0.03□□□□□ -2.4
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