RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf170A2RU37 121 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 DBX1A6NMT0 343 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 BET1O15155 118 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SPINT2O43291 252 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 CCNKO75909 580 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SLC22A5O76082 557 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR2A4O95047 310 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 HBZP02008 142 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 AADACP22760 399 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 GNRHRP30968 328 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 INSL3P51460 131 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB136Q30KP8 78 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 C4orf46Q504U0 113 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 KCTD9Q7L273 389 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 LRTM2Q8N967 370 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 BVESQ8NE79 360 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR2A7Q96R45 310 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 ING3Q9NXR8 418 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.3□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 hADV38S2A0JD32 116 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 FAM172BPA6NC97 362 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 GPR31O00270 319 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SSNA1O43805 119 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 YPEL1O60688 119 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SFT2D2O95562 160 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 PGAM2P15259 253 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 PPP1R1AQ13522 171 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 TEX38Q6PEX7 206 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 TCF23Q7RTU1 214 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 IL17DQ8TAD2 202 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 YPEL2Q96QA6 119 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 PHB2Q99623 299 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 RDH8Q9NYR8 311 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 CALYQ9NYX4 217 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 DPM3Q9P2X0 92 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 GAB2Q9UQC2 676 aa7.29□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 LEUTXA8MZ59 168 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 RGS11O94810 467 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 FAM106CPP0CH98 169 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 ANXA3P12429 323 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 AKR1C4P17516 323 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 S100GP29377 79 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 CEACAM3P40198 252 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 DLX6P56179 175 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 PIGPP57054 158 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SRPXP78539 464 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 EDDM3AQ14507 147 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 FCN2Q15485 313 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFA5Q16718 116 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR1L1Q8NH94 360 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF596Q8TC21 504 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 TOMM40LQ969M1 308 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 ARL11Q969Q4 196 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 GON7Q9BXV9 100 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 NAA60Q9H7X0 242 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.28□□□□□ -1.24
SMAD3-215ENST00000560424 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.28□□□□□ -1.24
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