RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RAB6AP20340 208 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CRHBPP24387 322 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 MYL9P24844 172 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 MAP2K4P45985 399 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 AQP4P55087 323 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DEFA5Q01523 94 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CDNFQ49AH0 187 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 FAM209BQ5JX69 171 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 Q6ZS49 121 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NECAP1Q8NC96 275 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DDB2Q92466 427 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.2□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 LINC00473A8K010 186 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 J3QRK9 145 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 BMPR1BO00238 502 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 MFNGO00587 321 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 FCGR3BO75015 233 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TPPPO94811 219 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 PRH1P02810 166 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CTXN2P0C2S0 81 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RAB3BP20337 219 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CD81P60033 236 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CDK10Q15131 360 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 LAX1Q8IWV1 398 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 MMD2Q8IY49 270 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 C5orf30Q96GV9 206 aa6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DPPA5A6NC42 116 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZNF785A8K8V0 405 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CD36P16671 472 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DTYMKP23919 212 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 KIR2DS2P43631 304 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 OR10A3P58181 314 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SSX1Q16384 188 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 GUCA2BQ16661 112 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 C15orf32Q32M92 178 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 HACD4Q5VWC8 232 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NRG4Q8WWG1 115 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NEURL2Q9BR09 285 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 OR51E2Q9H255 320 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 VCX3BQ9H321 246 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.18□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 OR11H12B2RN74 326 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 LGALS9O00182 355 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 OR2J3O76001 311 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 JTBO76095 146 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 OR2C1O95371 312 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 DHFRP00374 187 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 HLA-DQB1P01920 261 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 FOLR2P14207 255 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 GALP22466 123 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 MAS1LP35410 378 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 HSPA13P48723 471 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ZNF45Q02386 682 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 CNIH2Q6PI25 160 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 KCTD9Q7L273 389 aa6.17□□□□□ -1.42
COCH-211ENST00000557065 GPHB5Q86YW7 130 aa6.17□□□□□ -1.42
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