RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	PRSS8	Q16651	343 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM17	Q86X19	198 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TEX45	Q8NA69	505 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MRAP	Q8TCY5	172 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	GPX8	Q8TED1	209 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	IFT46	Q9NQC8	304 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	EHF	Q9NZC4	300 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	VSIG4	Q9Y279	399 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1B0GW64	132 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MSGN1	A6NI15	193 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SULT1C2	O00338	296 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TRGV3	P03979	118 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	HLA-DMA	P28067	261 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	GNRHR	P30968	328 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	PRSS3	P35030	304 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	HRH1	P35367	487 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TPPP2	P59282	170 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RUNX1	Q01196	453 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CBX3	Q13185	183 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	DYRK1A	Q13627	763 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SSX9	Q7RTT3	188 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	GPR141	Q7Z602	305 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RHOV	Q96L33	236 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	HMX3	A6NHT5	357 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CGB1	A6NKQ9	187 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM25A	B3EWG3	89 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM25C	B3EWG5	89 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM25G	B3EWG6	89 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC22A5	O76082	557 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	PRH1	P02810	166 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF45	Q02386	682 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF616	Q08AN1	781 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	LAX1	Q8IWV1	398 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	POC5	Q8NA72	575 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OR51H1	Q8NH63	302 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OR4S2	Q8NH73	311 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	DCUN1D4	Q92564	292 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MOB3A	Q96BX8	217 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CMTM3	Q96MX0	182 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SCOC	Q9UIL1	159 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	COL7A1	Q02388	2944 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	TEX22	C9J3V5	150 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	LINC01619	G3V211	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	CTDSP2	O14595	271 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	KBTBD11	O94819	623 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	S1PR2	O95136	353 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	TRBV12-3	P01733	135 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	RPA2	P15927	270 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	MSMO1	Q15800	293 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	ABHD1	Q96SE0	405 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	PHB2	Q99623	299 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	COA4	Q9NYJ1	87 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	KLK11	Q9UBX7	282 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555		M0QYG6	137 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	OR2A4	O95047	310 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	RLN1	P04808	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	OR8U8	P0C7N1	319 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PABPC1-222	ENST00000523555	TAS2R46	P59540	309 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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