RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM250H0YL14 139 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS12P56730 875 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ABHD3Q8WU67 409 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 Q96M66 194 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.51□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPB7O75200 414 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 CRYAAP02489 173 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 GPX1P07203 203 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ESDP10768 282 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 DTYMKP23919 212 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PSMB3P49720 205 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 LCN12Q6JVE5 192 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 LYZL4Q96KX0 146 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NRN1Q9NPD7 142 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR5B21A6NL26 309 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PAGE4O60829 102 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IAPPP10997 89 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 CCNOP22674 350 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PTGDSP41222 190 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR2T8A6NH00 312 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 LIPT2A6NK58 231 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PPYP01298 95 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PMCHP20382 165 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 CTSSP25774 331 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF525Q8N782 197 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 RCHY1Q96PM5 261 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.5□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 MLNRO43193 412 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IGHMP01871 453 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 HERV-K104P61576 105 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR4A47Q6IF82 309 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM56Q96MV1 263 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 UCN2Q96RP3 112 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IGHG3P01860 377 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 THBS3P49746 956 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SELENOVP59797 346 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 RHOGP84095 191 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PIGYQ3MUY2 71 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 PRR27Q6MZM9 219 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 BATF2Q8N1L9 274 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SPIN2AQ99865 258 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 AMTP48728 403 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 POLEQ07864 2286 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 NAPSAO96009 420 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf79P0CE67 100 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 GFRA1P56159 465 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ACSM6Q6P461 480 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 GNB4Q9HAV0 340 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.49□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ARR3P36575 388 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 FOXL1Q12952 345 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 GAPTQ8N292 157 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TNFRSF14Q92956 283 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SMPD2O60906 423 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 RELBQ01201 579 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZRM9 215 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 OR4C12Q96R67 309 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.48□□□□□ -1.05
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