RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506871.5

USP45-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, human

TSL 5

Gene USP45, Length 1,741 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP45-209	ENST00000506871	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871		M0R2Z0	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	OR1I1	O60431	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	LMX1B	O60663	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	TRAPPC6A	O75865	159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	C1orf105	O95561	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	TRGC2	P03986	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	NGFR	P08138	427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ATF1	P18846	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	GRPR	P30550	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	SRI	P30626	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ZNF83	P51522	516 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	DUSP2	Q05923	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	MALL	Q13021	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	CTBP1	Q13363	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	OPN5	Q6U736	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871		Q6ZSR9	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871		A0A0B4J2A0	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871		A0A1B0GX51	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871		A0A1W2PPI3	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871		K7EPK0	472 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	GABRP	O00591	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	YPEL1	O60688	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ZFAND5	O76080	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	CHRM4	P08173	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	EVI2A	P22794	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		4.53	□□□□□ -1.68
USP45-209	ENST00000506871	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871		A0A0B4J2E0	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871		A0A1B0GX12	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	ODAM	A1E959	279 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871		F5H5P2	479 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871		J3KT08	172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	MLNR	O43193	412 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	NDUFS7	O75251	213 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	NUDT3	O95989	172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	MOS	P00540	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	PLAU	P00749	431 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
USP45-209	ENST00000506871	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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