RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CX3CL1	P78423	397 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF726P1	Q15940	193 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5AS1	Q8N127	324 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIGC	Q92535	297 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BML4	177 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNPH1	O43598	174 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE2B	Q13066	116 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF77	Q15935	545 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ETDB	Q3ZM63	59 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE2E	Q4V326	116 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARTN	Q5T4W7	220 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		6.96	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MPDZ	O75970	2070 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE12J	A6NER3	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		H0YGG7	62 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	MLNR	O43193	412 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE7	O76087	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE12F	P0CL80	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE12G	P0CL81	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE12I	P0CL82	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERVK-16	P61578	105 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE4	Q13068	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM53B	Q14153	422 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	NT5C	Q8TCD5	201 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	IRF7	Q92985	503 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	WIPF3	A6NGB9	483 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		H0YJW9	148 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT62	P0C5K7	136 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSG2	P11465	335 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRD5A2	P31213	254 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLAUR	Q03405	335 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CENPW	Q5EE01	88 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q96M66	194 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		6.96	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PPV9	198 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	MPDU1	O75352	247 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	BCL3	P20749	454 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CTGF	P29279	349 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARG2	P78540	354 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACSM6	Q6P461	480 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM25	Q86YD3	366 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF721	Q8TF20	911 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RCHY1	Q96PM5	261 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	OSTC	Q9NRP0	149 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUSP13	Q9UII6	198 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	DPT	Q07507	201 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	C10orf35	Q96D05	121 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	HES4	Q9HCC6	221 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PRU2	124 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R135	149 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL2	P13500	99 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	SELP	P16109	830 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	FHL1	Q13642	323 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CBLN3	Q6UW01	205 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF799	Q96GE5	643 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	NRTN	Q99748	197 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	VGLL1	Q99990	258 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	hADV38S2	A0JD32	116 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYGC	P07315	174 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	COX8A	P10176	69 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RASL11A	Q6T310	242 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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