RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	PPT1	P50897	306 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	UBE2K	P61086	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	HTD2	P86397	168 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	BAX	Q07812	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ICAM4	Q14773	271 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	MSMO1	Q15800	293 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	STUM	Q69YW2	141 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8N7P7	452 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	DDB2	Q92466	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CCL13	Q99616	98 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.76	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	YPEL1	O60688	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GOSR1	O95249	250 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	PRH1	P02810	166 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SOD3	P08294	240 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4A8	P0C604	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB5C	P51148	216 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2B8P	P59922	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SVBP	Q8N300	66 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.75	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730		M0R1X1	148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SPINT2	O43291	252 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	FCGR3B	O75015	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SNAPIN	O95295	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CRYBA1	P05813	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ADH4	P08319	380 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GZMH	P20718	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	S100G	P29377	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CDKN1A	P38936	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR12	P47775	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms