RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490332.2

PTPRK-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-213	ENST00000490332	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	UBE2K	P61086	200 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MUCL1	Q96DR8	90 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	SNX22	Q96L94	193 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332		A0A1W2PR80	420 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332		A6NLC8	198 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332		C9JQL5	133 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MGST3	O14880	152 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74	9e-6	■■□□□ 11.6
PTPRK-213	ENST00000490332	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TNFSF12	O43508	249 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	YPEL1	O60688	119 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM50A	O95807	157 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	HBZ	P02008	142 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CRYAA	P02489	173 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CELA3B	P08861	270 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	NFYB	P25208	207 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	PRDX2	P32119	198 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TIMP3	P35625	211 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	GLRX	P35754	106 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MPV17	P39210	176 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OR3A1	P47881	315 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	RAB7A	P51149	207 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	FABP6	P51161	128 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	GNB2	P62879	340 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	S100A12	P80511	92 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-213	ENST00000490332	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.2	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms