RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	POC5	Q8NA72	575 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	BVES	Q8NE79	360 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MOB3A	Q96BX8	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RRH	O14718	337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDEF	O95238	335 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB3D	O95716	219 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CD3D	P04234	171 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	AP3S2	P59780	193 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD4A	Q8N468	514 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DISC1	C4P0D8	188 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424		M0QYG6	137 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RAMP3	O60896	148 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	AKAIN1	P0CW23	69 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FHL3	Q13643	280 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SOST	Q9BQB4	213 aa		13.5	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR31	O00270	319 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FCGR3B	O75015	233 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-16	P04430	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ECI1	P42126	302 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	UCP3	P55916	312 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00205	P59089	165 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00473	A8K010	186 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFSF12	O43508	249 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYZL1	O95825	349 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	HRAS	P01112	189 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CD74	P04233	296 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PGAM2	P15259	253 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTFR	P26992	372 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	INPP1	P49441	399 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	INSL3	P51460	131 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PSG5	Q15238	335 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8N402	240 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DDB2	Q92466	427 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RITA1	Q96K30	269 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	VSIG4	Q9Y279	399 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NHS1	94 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	GNRHR	P30968	328 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ETV6	P41212	452 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB9A	P51151	201 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TERB2	Q8NHR7	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424		I3L521	148 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A17	O43808	307 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CX3CL1	P78423	397 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX45	Q8NA69	505 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25

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