RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 TPPP3Q9BW30 176 aa6.53□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.53□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.53□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.53□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 A6NJY4 79 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 H3BP45 60 aa6.53□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 DANCRP0C864 163 aa6.53□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 Q1RN00 199 aa6.53□□□□□ -1.36
USP54-210ENST00000466048 SP6Q3SY56 376 aa6.53□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.53□□□□□ -1.36
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USP54-210ENST00000466048 VENTXO95231 258 aa6.52□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 CA2P00918 260 aa6.52□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 PECRQ9BY49 303 aa6.52□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.52□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.52□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 CDH23Q9H251 3354 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.51□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.51□□□□□ -1.37
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