RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-216ENST00000462421 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 MAS1LP35410 378 aa7□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 GPR107Q5VW38 600 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 Q6ZPA2 131 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF429Q86V71 674 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 SPAG16Q8N0X2 631 aa7□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 ZNF491Q8N8L2 437 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 MINDY2Q8NBR6 621 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 OR5T1Q8NG75 326 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 OR4A5Q8NH83 315 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 SLC25A38Q96DW6 304 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RAX2Q96IS3 184 aa7□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 OR2A7Q96R45 310 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RSRP1Q9BUV0 290 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RABL2BQ9UNT1 228 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 SULT1C2O00338 296 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 FCN1O00602 326 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 TNFSF12O43508 249 aa6.99□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 SNAPC5O75971 98 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 ATG12O94817 140 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 IGHV3-11P01762 117 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 PMP2P02689 132 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 OR9G9P0C7N8 305 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 PGAM2P15259 253 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 ECI1P42126 302 aa6.99□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 PRSS8Q16651 343 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RPEL1Q2QD12 228 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 SSX9Q7RTT3 188 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.99□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 OR51H1Q8NH63 302 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.99□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 P2RX4Q99571 388 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 THYN1Q9P016 225 aa6.99□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 FAM223BA6NKX1 122 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 SSX5O60225 188 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 KBTBD11O94819 623 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 HPRT1P00492 218 aa6.98□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 NQO2P16083 231 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 HLA-DMAP28067 261 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 TAS2R31P59538 309 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 ATP5G2Q06055 141 aa6.98□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.98□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 SNAPC3Q92966 411 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 CYYR1Q96J86 154 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RHOVQ96L33 236 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 KLK15Q9H2R5 256 aa6.98□□□□□ -1.29
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DDX39B-216ENST00000462421 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 SCOCQ9UIL1 159 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 LINC00473A8K010 186 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 GPR31O00270 319 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-216ENST00000462421 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
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