RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 SPDEFO95238 335 aa10.28□□□□□ -0.76
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C9orf3-210ENST00000462125 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
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C9orf3-210ENST00000462125 DEFB136Q30KP8 78 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf3-210ENST00000462125 AKIRIN2Q53H80 203 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf3-210ENST00000462125 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf3-210ENST00000462125 DPF1Q92782 380 aa10.28□□□□□ -0.76
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C9orf3-210ENST00000462125 SDHAF2Q9NX18 166 aa10.28□□□□□ -0.76
C9orf3-210ENST00000462125 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
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C9orf3-210ENST00000462125 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.27□□□□□ -0.77
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C9orf3-210ENST00000462125 C5orf30Q96GV9 206 aa10.26□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 OR2D2Q9H210 308 aa10.26□□□□□ -0.77
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C9orf3-210ENST00000462125 GINS4Q9BRT9 223 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.25□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.25□□□□□ -0.77
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C9orf3-210ENST00000462125 OR8U8P0C7N1 319 aa10.24□□□□□ -0.77
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C9orf3-210ENST00000462125 HLA-DMAP28067 261 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 DUTP33316 252 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 GNB1P62873 340 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF616Q08AN1 781 aa10.24□□□□□ -0.77
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C9orf3-210ENST00000462125 FXYD3Q14802 87 aa10.24□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 ACTBL2Q562R1 376 aa10.24□□□□□ -0.77
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C9orf3-210ENST00000462125 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.24□□□□□ -0.77
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C9orf3-210ENST00000462125 TMEM235A6NFC5 223 aa10.23□□□□□ -0.77
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C9orf3-210ENST00000462125 SSX5O60225 188 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 BRI3O95415 125 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS3P35030 304 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 INSL3P51460 131 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 BVESQ8NE79 360 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 OR52I2Q8NH67 350 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 ARPC1AQ92747 370 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 RHOVQ96L33 236 aa10.23□□□□□ -0.77
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