RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 TXNL1O43396 289 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R46P59540 309 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX5Q96PT3 197 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 AGMATQ9BSE5 352 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 BEX1Q9HBH7 125 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGEF1-205ENST00000450873 ATG12O94817 140 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTBP60709 375 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 SPCS3P61009 180 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 GUCA2BQ16661 112 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.52□□□□□ -1.04
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RABGEF1-205ENST00000450873 C3orf56Q8N813 242 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52I2Q8NH67 350 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 PIFOQ8TCI5 191 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
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RABGEF1-205ENST00000450873 ARL6Q9H0F7 186 aa8.52□□□□□ -1.04
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RABGEF1-205ENST00000450873 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.52□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 OR5H8P0DN80 308 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 FOLR2P14207 255 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 RPA2P15927 270 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.52□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 MOB3BQ86TA1 216 aa8.52□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 GAB2Q9UQC2 676 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 TIMM23O14925 209 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 FCGR2CP31995 323 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 RAB18Q9NP72 206 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 EHFQ9NZC4 300 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2D2Q9H210 308 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR137BO60478 399 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 CRYBA1P05813 215 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 TBPP20226 339 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 VAMP1P23763 118 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 HRH1P35367 487 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 SMCO1Q147U7 214 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-205ENST00000450873 AWAT1Q58HT5 328 aa8.5□□□□□ -1.05
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