RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430287.1

USP9YP16-201, Transcript of USP9Y pseudogene 16, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP16, Length 407 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP16-201ENST00000430287 GP1BAP07359 652 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TRGC1P0CF51 173 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 CCL5P13501 91 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 KCNJ3P48549 501 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 CDK9P50750 372 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 H2BFSP57053 126 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM33P57088 247 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TNNC1P63316 161 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 SPATA8Q6RVD6 105 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 GPHB5Q86YW7 130 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 BAP18Q8IXM2 172 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM86AQ8N2M4 240 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 C12orf29Q8N999 325 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 ZNF565Q8N9K5 539 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 OR8B3Q8NGG8 313 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 SERPINB11Q96P15 392 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 NMNAT3Q96T66 252 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 SMR3AQ99954 134 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TRABDQ9H4I3 376 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 POFUT2Q9Y2G5 429 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 GPR98Q8WXG9 6306 aa-0.01□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 SETD5Q9C0A6 1442 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 A0A1B0GW54 56 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 GOLGA8RI6L899 631 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 NDUFS8O00217 210 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 ATP5G1P05496 136 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TFPTP0C1Z6 253 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 CFL1P23528 166 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 AP1S1P61966 158 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 AKR1C1Q04828 323 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TEX36Q5VZQ5 186 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 DHFR2Q86XF0 187 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 Q8N6K4 173 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 OR52E4Q8NGH9 312 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 STOML3Q8TAV4 291 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 LINC00526Q96FQ7 95 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 PARVAQ9NVD7 372 aa-0.02□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 NUP160Q12769 1436 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TRAPPC2LH3BP13 241 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 SULT1C2O00338 296 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TNFAIP8O95379 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 RUNX1Q01196 453 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 FABP5Q01469 135 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 GNA13Q14344 377 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 LRRC26Q2I0M4 334 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 C9orf64Q5T6V5 341 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 SLC22A24Q8N4F4 322 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TESCQ96BS2 214 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 MSANTD3Q96H12 275 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM208Q9BTX3 173 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 NAT8Q9UHE5 227 aa-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
USP9YP16-201ENST00000430287 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 FLT4P35916 1363 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 TMEM94Q12767 1356 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 IRGMA1A4Y4 181 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 C19orf84I3L1E1 186 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 ITGB1BP1O14713 200 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 PPBPP02775 128 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 LINC00614P0C842 121 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 UBBP0CG47 229 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 F8A1P23610 371 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 MIPP30301 263 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 LCN1P31025 176 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 HPCAP84074 193 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 STX3Q13277 289 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 FAM27BQ5VT28 67 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 C17orf78Q8N4C9 275 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 OR10D3Q8NH80 312 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 ACOT12Q8WYK0 555 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 SERPINI1Q99574 410 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 GLI3P10071 1580 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 A0A087WX48 190 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 METTL15A6NJ78 407 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 BRI3O95415 125 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 HLA-DQB2P05538 268 aa-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
USP9YP16-201ENST00000430287 RAB2BQ8WUD1 216 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms