RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MYO7AQ13402 2215 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HEPN1Q6WQI6 88 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ORMDL3Q8N138 153 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF124Q15973 351 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 DCAF10Q5QP82 559 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 VN1R1Q9GZP7 353 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 RNF7Q9UBF6 113 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PF4V1P10720 104 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR10AC1Q8NH08 325 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HSPB9Q9BQS6 159 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GNG7O60262 68 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CKS2P33552 79 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PCP4P48539 62 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 PSG5Q15238 335 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 NKG7Q16617 165 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CT55Q8WUE5 264 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H4GQ99525 98 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 HES7Q9BYE0 225 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 LPAR5Q9H1C0 372 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 IAPPP10997 89 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 APCDD1LQ8NCL9 501 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A22Q9H936 323 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OTORQ9NRC9 128 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM238C9JI98 176 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR3A4PP47883 348 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TBR1Q16650 682 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MOGAT3Q86VF5 341 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CLDND2Q8NHS1 167 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MOSPD3O75425 235 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR2J3O76001 311 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 COX11Q9Y6N1 276 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FAM106CPP0CH98 169 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MFAP2P55001 183 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SPNS3Q6ZMD2 512 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0U1RQS6 177 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GV90 55 aa4.22□□□□□ -1.73
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