RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 OR2D3Q8NGH3 330 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 SMIM6P0DI80 62 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 PQLC2Q6ZP29 291 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 OR4C13Q8NGP0 309 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 OR13A1Q8NGR1 328 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 LINC01560Q8TB33 94 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 TMEM186Q96B77 213 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 IQCF6A8MYZ5 107 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 ARF6P62330 175 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 ABHD17AQ96GS6 310 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 UFC1Q9Y3C8 167 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 MUC15Q8N387 334 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 FAM89BQ8N5H3 189 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 FGFBP3Q8TAT2 258 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 PTTG1IPP53801 180 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 HIST3H3Q16695 136 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 MARVELD3Q96A59 401 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 B9A039 149 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 RPL29P47914 159 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 VAMP3Q15836 100 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 LRP11Q86VZ4 500 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 TSC2P49815 1807 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 SCNM1Q9BWG6 230 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 FAM57AQ8TBR7 257 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 MIOXQ9UGB7 285 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 THADAQ6YHU6 1953 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 ZNF735P0CB33 412 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 PRNTQ86SH4 94 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 J3KRW8 73 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 CDK2AP1O14519 115 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 DCTN5Q9BTE1 182 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 FAM106CPP0CH98 169 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 CLEC2AQ6UVW9 174 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 SEMA5BQ9P283 1151 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 A0A0A6YYD4 124 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 TRAV34A0A0B4J273 112 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 CRYGSP22914 178 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 ISLRO14498 428 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 APCSP02743 223 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 ARL14EPLP0DKL9 152 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 C17orf98A8MV24 154 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 GGNQ86UU5 652 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 ZNF146Q15072 292 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 RPRMQ9NS64 109 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 TRGC2P03986 189 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 FAM87AP0C7U9 286 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 FOSL1P15407 271 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 GBGT1Q8N5D6 347 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 FAM216BQ8N7L0 139 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 OR4A5Q8NH83 315 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 CLEC7AQ9BXN2 247 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 NLRC5Q86WI3 1866 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 MFAP2P55001 183 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 KLRB1Q12918 225 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 TMEM106BQ9NUM4 274 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-201ENST00000345716 REG1AP05451 166 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 RPL30P62888 115 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 LY6G6FQ5SQ64 297 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 ZNF137PP52743 207 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 SLC35B1P78383 322 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 NABP1Q96AH0 204 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 SPRR3Q9UBC9 169 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 CACNA1DQ01668 2161 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 ELOBQ15370 118 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 C19orf35Q6ZS72 473 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 GUCD1Q96NT3 240 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 PTPRDP23468 1912 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 WDFY1Q8IWB7 410 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 C8orf88P0DMB2 117 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 WDR31Q8NA23 367 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 PGPA6NDG6 321 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 GPR179Q6PRD1 2367 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 GFRA1P56159 465 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 BSPH1Q075Z2 132 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 OR2T8A6NH00 312 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 LIPFP07098 398 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 PNKDQ8N490 385 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 IGKV1-13P0DP09 117 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 TMEM208Q9BTX3 173 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 LOC105371242A0A075B767 164 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-201ENST00000345716 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms