RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MED9Q9NWA0 146 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RNF7Q9UBF6 113 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 COL6A6A6NMZ7 2263 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MEIKINA0A087WXM9 373 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 B5MCH6 92 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RLN1P04808 185 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FPR2P25090 351 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR4A47Q6IF82 309 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RDH5Q92781 318 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CHST6Q9GZX3 395 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TANC2Q9HCD6 1990 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 AMY2AP04746 511 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 EDN2P20800 178 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 LCN2P80188 198 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PCNX1Q96RV3 2341 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SPTA1P02549 2419 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CORTO00230 105 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TFF1P04155 84 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TYMSP04818 313 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CSN2P05814 226 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PDLIM4P50479 330 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TAS2R46P59540 309 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZPA2 131 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR52E5Q8NH55 327 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 P2RX4Q99571 388 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IFNL4K9M1U5 179 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 NDUFB6O95139 128 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 VENTXO95231 258 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 NAPSAO96009 420 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 LMO1P25800 156 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 COL10A1Q03692 680 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CD177Q8N6Q3 437 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 COLCA2A8K830 154 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PPIHO43447 177 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IGHV2-5P01817 119 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PSG2P11465 335 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 CDKN1AP38936 164 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 LGALS7P47929 136 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PPOXP50336 477 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PAX5Q02548 391 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 NIT1Q86X76 327 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR5R1Q8NH85 324 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SIRPDQ9H106 197 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 Q9N2K0 584 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 METRNQ9UJH8 293 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 LRRC30A6NM36 301 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 PRDX2P32119 198 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 IQCJQ1A5X6 159 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 FAM201AQ5SY85 155 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZS49 121 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 SPICQ8N5J4 248 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 OR51J1Q9H342 316 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 HRH4Q9H3N8 390 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 WFDC1Q9HC57 220 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-201ENST00000341935 DYSFO75923 2080 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms