RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PIN1P1O15428 100 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRM-201ENST00000332175 TRGC2P03986 189 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRM-201ENST00000332175 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
PTPRM-201ENST00000332175 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf66Q9H5L9 145 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRM-201ENST00000332175 RAMP1O60894 148 aa19.08■□□□□ 0.64
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PTPRM-201ENST00000332175 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa19.07■□□□□ 0.64
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PTPRM-201ENST00000332175 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
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PTPRM-201ENST00000332175 IGKV1D-33P01593 117 aa19.02■□□□□ 0.64
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PTPRM-201ENST00000332175 HIST1H4GQ99525 98 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRM-201ENST00000332175 PET117Q6UWS5 81 aa19.02■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 RRHO14718 337 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 SIAH2O43255 324 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 ACP7Q6ZNF0 438 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 FBXL15Q9H469 300 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0B4J293 547 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 OR4A47Q6IF82 309 aa19.01■□□□□ 0.63
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