RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 GYG2O15488 501 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK2AP2O75956 126 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 BPNT1O95861 308 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA10P01566 189 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA21P01568 189 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA17P01571 189 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV2-23P01705 113 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PRH1P02810 166 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf88P0DMB2 117 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL12AP19105 171 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMB6P28072 239 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PAFAH1B2P68402 229 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK10Q15131 360 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PLET1Q6UQ28 207 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5B3Q8NH48 314 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CMTM3Q96MX0 182 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 FAAP24Q9BTP7 215 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF126Q9BV68 326 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 AP4S1Q9Y587 144 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 NAPSAO96009 420 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 NPY1RP25929 384 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MAS1LP35410 378 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 GYS2P54840 703 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGIRRQ6IA17 410 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10J5Q8NHC4 309 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC29A1Q99808 456 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2D2Q9H210 308 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf4Q9NQ89 552 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 RDH8Q9NYR8 311 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 POMPQ9Y244 141 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.79□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf90A8MZG2 172 aa5.78□□□□□ -1.48
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PGGT1B-201ENST00000296642 CRYZL1O95825 349 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
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PGGT1B-201ENST00000296642 MIFP14174 115 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SRMP19623 302 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 EDN2P20800 178 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 DCKP27707 260 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R43P59537 309 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TRDCB7Z8K6 153 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R2N4 97 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 RTL8CO15255 209 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 OGG1O15527 345 aa5.77□□□□□ -1.49
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PGGT1B-201ENST00000296642 DIRAS3O95661 229 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-23P01764 117 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 AMBPP02760 352 aa5.77□□□□□ -1.49
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PGGT1B-201ENST00000296642 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE1DQ5T752 114 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.77□□□□□ -1.49
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PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 GGHQ92820 318 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC140Q96MF4 163 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 GINS4Q9BRT9 223 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 TM2D1Q9BX74 207 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51E2Q9H255 320 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9N2K0 584 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.77□□□□□ -1.49
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