RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 OGG1O15527 345 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 CA2P00918 260 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA1644Q3SXP7 199 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNK7Q9Y2U2 307 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 PDE6DO43924 150 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP6V0CP27449 155 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 FGFRL1Q8N441 504 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 NGFRP08138 427 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 CCL3L1P16619 93 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 TSPOP30536 169 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ATOH7Q8N100 152 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 DRAM1Q8N682 238 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 C10orf35Q96D05 121 aa10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 SIAH2O43255 324 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ICAM4Q14773 271 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ASCL4Q6XD76 172 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 HIST1H4GQ99525 98 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV1-2P23083 117 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 TBR1Q16650 682 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 MRAPQ8TCY5 172 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ANAPC16Q96DE5 110 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5AC2Q9NZP5 309 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 PSG9Q00887 426 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 CBLN2Q8IUK8 224 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 IL19Q9UHD0 177 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 LHFPL6Q9Y693 200 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ASAH2BP0C7U1 165 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 EGR1P18146 543 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM209BQ5JX69 171 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 PILRAQ9UKJ1 303 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 RREB1Q92766 1687 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 HKR1P10072 659 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 CRYBB3P26998 211 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 KLRD1Q13241 179 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF585BQ52M93 769 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 GRIFINA4D1Z8 144 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BQ15 152 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV3-53P01767 116 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM160Q9NX00 188 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 C1QL1O75973 258 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 SCMH1Q96GD3 660 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 THADAQ6YHU6 1953 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFA2O43678 99 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ALX3O95076 343 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ERVK11-1P61568 191 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 OR51M1Q9H341 326 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0U1RRA0 63 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 GGCTO75223 188 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 ARPC1AQ92747 370 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR146Q96CH1 333 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 RTTNQ86VV8 2226 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 LEMD1Q68G75 181 aa10.09□□□□□ -0.79
UBASH3B-201ENST00000284273 MARCH11A6NNE9 402 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 RRHO14718 337 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 EFEMP2O95967 443 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 KLK2P20151 261 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 CFHR1Q03591 330 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 UBR3Q6ZT12 1888 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 FER1L5A0AVI2 2057 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 KLF4O43474 513 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 ESPL1Q14674 2120 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 LY6HO94772 140 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZT83 130 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 SPSB4Q96A44 273 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 ARAP2Q8WZ64 1704 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 PTP4A3O75365 173 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 SELENOTP62341 195 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR82Q6UXN9 313 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 GALNT14Q96FL9 552 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.08□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 OR9G4Q8NGQ1 327 aa10.07□□□□□ -0.8
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms