RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 G3V3Y1 287 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 BMPR1BO00238 502 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 ZXDAP98168 799 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 PNKDQ8N490 385 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 DLL3Q9NYJ7 618 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CLDN14O95500 239 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 IGLL1P15814 213 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TCL1AP56279 114 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 RHOGP84095 191 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CEACAM16Q2WEN9 425 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 C19orf35Q6ZS72 473 aa17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PPC4 97 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 RNF212BA8MTL3 300 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 REG1AP05451 166 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CCR5P51681 352 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TXNDC17Q9BRA2 123 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 WDR83OSQ9Y284 106 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 MT-ND6P03923 174 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 STAG3L2P0CL84 134 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 STAG3L3P0CL85 134 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 GLB1P16278 677 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 SRD5A2P31213 254 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 Q56UQ5 140 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 CORO2AQ92828 525 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa17.77■□□□□ 0.44
ODC1-201ENST00000234111 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 CCL2P13500 99 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 CD1BP29016 333 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 ARG2P78540 354 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 PMCHL1Q16048 86 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 CEACAM21Q3KPI0 293 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 ZNF718Q3SXZ3 478 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 WDR73Q6P4I2 378 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 SLC23A3Q6PIS1 610 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 CLEC2AQ6UVW9 174 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 FAM58AQ8N1B3 248 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 CPT1CQ8TCG5 803 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 OR2D2Q9H210 308 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 CLEC1BQ9P126 229 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 CX3CL1P78423 397 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 ZNF596Q8TC21 504 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 SDK2Q58EX2 2172 aa17.76■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 TMEM238C9JI98 176 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 P0C879 139 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 MYF5P13349 255 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 RPL30P62888 115 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 FXYD3Q14802 87 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 OR4A47Q6IF82 309 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 RLN3Q8WXF3 142 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 GTF3C1Q12789 2109 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 CXorf1O96002 111 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 GABRA2P47869 451 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 LRRC10Q5BKY1 277 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 ZNF439Q8NDP4 499 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 NEUROG1Q92886 237 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 USF3Q68DE3 2245 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 DKK1O94907 266 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 OTX2P32243 289 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 MPV17L2Q567V2 206 aa17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 OR2T8A6NH00 312 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 C15orf62A8K5M9 175 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 TAX1BP3O14907 124 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 HYAL1Q12794 435 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 OR4P4Q8NGL7 312 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 NUDT11Q96G61 164 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 DEFB126Q9BYW3 111 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 ZIC3O60481 467 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 RHOBP62745 196 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 MIC13Q5XKP0 118 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 DOLPP1Q86YN1 238 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 SLC24A4Q8NFF2 622 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 PRDM14Q9GZV8 571 aa17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 AAED1Q7RTV5 226 aa17.73■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 PLXDC1Q8IUK5 500 aa17.73■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 C9JCJ5 164 aa17.73■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 PCBD1P61457 104 aa17.73■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 EBLN2Q6P2I7 272 aa17.73■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 H0YJW9 148 aa17.72■□□□□ 0.43
ODC1-201ENST00000234111 IGHV3-9P01782 118 aa17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms