RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 YEATS4O95619 227 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 CFAP100Q494V2 611 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 NFAT5O94916 1531 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PDE4CQ08493 712 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 INTS13Q9NVM9 706 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 SERPINC1P01008 464 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 C8orf76Q96K31 380 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PALLDQ8WX93 1383 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 VSTM4Q8IW00 320 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 C5P01031 1676 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.65■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 MAST3O60307 1309 aa23.65■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.65■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PNOCQ13519 176 aa23.65■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.65■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 ATP8B1O43520 1251 aa23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 MAP3K9P80192 1104 aa23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 MYL5Q02045 173 aa23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 SLC39A6Q13433 755 aa23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 ANO1Q5XXA6 986 aa23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 FUT8Q9BYC5 575 aa23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 PARD6BQ9BYG5 372 aa23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.64■■□□□ 1.38
PMS1-222ENST00000639501 H3BQF6 201 aa23.64■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 CMA1P23946 247 aa23.64■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 GNG11P61952 73 aa23.64■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.64■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 COPS6Q7L5N1 327 aa23.64■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.64■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB9Q96C00 473 aa23.64■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.64■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN26Q16670 478 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 FANCLQ9NW38 375 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 KIF1AQ12756 1690 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 KIFC2Q96AC6 838 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 TPM1P09493 284 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 CASQ1P31415 396 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 TRIM66O15016 1216 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 HAND2P61296 217 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 M0R2C6 588 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP6O43182 974 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN12O43309 604 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 CDC27P30260 824 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 SYKP43405 635 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 DHX58Q96C10 678 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 CBFA2T2O43439 604 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 PDE4BQ07343 736 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 SHC4Q6S5L8 630 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 AIFM3Q96NN9 605 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 TSPYL1Q9H0U9 437 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 BRAPQ7Z569 592 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 DESI2Q9BSY9 194 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 FOXP2O15409 715 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 BMP6P22004 513 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 TIMM10P62072 90 aa23.59■■□□□ 1.37
PMS1-222ENST00000639501 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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