RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619533.1

CNTNAP4-208, Transcript of contactin associated protein like 4, human

Gene CNTNAP4, Length 1,856 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SUCLG2	Q96I99	432 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	JAG2	Q9Y219	1238 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		7.6	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TBC1D8	O95759	1140 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PRR29	P0C7W0	189 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RGS19	P49795	217 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SREBF2	Q12772	1141 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	UBE4A	Q14139	1066 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	VEZT	Q9HBM0	779 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CNTNAP4-208	ENST00000619533	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CLRN2	A0PK11	232 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TM4SF4	P48230	202 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	GYG1	P46976	350 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SPRYD7	Q5W111	196 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PTPRC	P08575	1304 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533		E9PSI1	815 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	METTL24	Q5JXM2	366 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	UTY	O14607	1347 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZNF521	Q96K83	1311 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	GPR25	O00155	361 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	INHBE	P58166	350 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TNFAIP1	Q13829	316 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RASA3	Q14644	834 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	KAZALD1	Q96I82	304 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	WNK4	Q96J92	1243 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FZD1	Q9UP38	647 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PCNT	O95613	3336 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533		A0A1B0GUL6	1792 aa		7.56	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	UNCX	A6NJT0	531 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FKTN	O75072	461 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TNNI2	P48788	182 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SOX10	P56693	466 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	LRRC24	Q50LG9	513 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CRK	P46108	304 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	SLFN5	Q08AF3	891 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		7.55	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	AOX1	Q06278	1338 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	PDE8B	O95263	885 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	IFNL1	Q8IU54	200 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		7.54	□□□□□ -1.2
CNTNAP4-208	ENST00000619533	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		7.54	□□□□□ -1.2

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