RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	HTT	P42858	3142 aa		18.63	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	EYA2	O00167	538 aa		18.62	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	MEIS3	Q99687	375 aa		18.62	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	18.61	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	MYO1B	O43795	1136 aa		18.61	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.61	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		18.61	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	AK9	Q5TCS8	1911 aa		18.61	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	GPR25	O00155	361 aa		18.6	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.6	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		18.6	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	RGS19	P49795	217 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	CAP1	Q01518	475 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	ELP3	Q9H9T3	547 aa		18.59	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	CCER2	I3L3R5	266 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	ADORA1	P30542	326 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.58	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	SREBF2	Q12772	1141 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	IFNL1	Q8IU54	200 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	PTPN18	Q99952	460 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	CENPF	P49454	3210 aa		18.57	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	DOCK2	Q92608	1830 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.56	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC5A1	P13866	664 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	PRDX5	P30044	214 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	PHKA1	P46020	1223 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	VGLL4	Q14135	290 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	TEKT1	Q969V4	418 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	OPTN	Q96CV9	577 aa		18.55	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	KIF16B	Q96L93	1317 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	BCAR3	O75815	825 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	ATP2B3	Q16720	1220 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	LPIN2	Q92539	896 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	FKTN	O75072	461 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	TNFAIP1	Q13829	316 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	18.53	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		18.53	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	BRCA2	P51587	3418 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	CRHR2	Q13324	411 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		18.52	■□□□□ 0.56
FCHO1-231	ENST00000600201	CIAO1	O76071	339 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	SLURP2	P0DP57	97 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	TRIM27	P14373	513 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	NFIA	Q12857	509 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		18.51	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	OTUD5	Q96G74	571 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	COPRS	Q9NQ92	184 aa		18.5	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	TNNI2	P48788	182 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	TIMM10	P62072	90 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	MAP3K9	P80192	1104 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	TCP10	Q12799	353 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		18.49	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	TFCP2	Q12800	502 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC102B	Q68D86	513 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	MIER1	Q8N108	512 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	WRNIP1	Q96S55	665 aa		18.48	■□□□□ 0.55
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		18.48	■□□□□ 0.55

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